内设机构
　　（一）办公室。负责文电、会务、机要、档案等机关日常运转工作；承担信息、安全保卫、保密、信访、政务公开、政务信息化、宣传等工作。
　　（二）计划财务科。研究拟订水利发展规划、重要江河湖泊流域综合规划、水资源综合规划、重大水利专业专项规划。审核水利水电工程项目建议书、可行性研究报告。组织指导水工程建设项目合规性审查。承担水利统计工作。提出中央预算内水利投资、中央水利财政资金和省级及市级水利建设资金安排建议，并指导资金使用。负责编制运转性资金预算并组织实施。承担财务管理、资产管理和内部审计工作。提出有关水利价格、收费、信贷的建议。承担水利资金管理使用、水利工程建设管理的审计监督及绩效评价工作。
　　（三）政策法规和水资源管理科（市节约用水办公室）。组织起草有关地方规范性文件。组织协调水利部门转变政府职能、深化行政审批制度改革有关工作。承担有关规范性文件的合法性审查工作。指导监督水行政执法。承担局行政应诉、行政复议、行政赔偿及普法宣传、法律顾问等相关工作。承担实施最严格水资源管理制度相关工作，组织实施水资源取水许可、水资源论证等制度，指导开展水资源有偿使用工作。指导水量分配工作并监督实施。组织编制水资源保护规划，指导饮用水水源保护、河湖水生态保护与修复及河湖水系连通工作。组织开展水资源调查评价有关工作，编制发布市水资源公报。参与编制水功能区划和指导入河排污口设置管理。指导地下水相关开发利用、水资源管理保护、超采区综合治理。拟订节约用水政策，组织编制并协调实施节约用水规划，组织指导计划用水、节约用水工作。组织实施用水总量控制、用水效率控制、计划用水和定额管理制度。指导和推动节水型社会建设工作。指导城市污水处理回用等非常规水资源开发利用。
　　（四）河湖管理科。负责水域及其岸线的管理和保护工作。指导江河湖泊、河口滩涂的开发、治理和保护工作。指导监督河道采砂管理工作，组织指导河道采砂计划的编制。组织实施河道管理范围内工程建设方案审查制度，组织指导有关防洪论证工作。承担推进河长制湖长制的组织实施具体工作。
　　（五）水利工程建设管理科。指导水利工程建设管理，组织制定有关制度并监督实施。组织指导水利工程蓄水安全鉴定和验收，指导江海堤围、水库、水闸、引水工程的除险加固等建设管理。指导水利建设市场的监督管理和水利建设市场信用体系建设。指导水利设施的管理、保护和综合利用。组织编制水库运行调度规程，指导水库、堤防、水闸、水电站大坝、农村水电站等水利工程的运行管理与划界。组织指导水利工程管理体制改革工作。
　　（六）农村水利水电与水土保持科。指导农村水利工作。组织开展农村大中型灌排工程、涝区治理工程的建设与改造。指导农村饮水安全工程建设管理和节水灌溉。组织拟订全市农村水能资源开发的政策及开发规划，指导农村水能资源开发、农村水电站改造和水电农村电气化工作。指导农村水利社会化服务体系建设。负责实施乡村振兴战略水利保障工作。承担水土流失综合防治工作，组织编制水土保持规划并监督实施，组织水土流失监测、预报并公告。按权限审核开发建设项目水土保持方案并监督实施。
　　（七）水库移民科。执行移民安置政策和制度，审核大中型水利水电工程移民安置规划。负责全市大中型水利水电工程移民安置管理和监督工作，组织实施水利水电工程移民安置验收、监督评估等制度，组织新建水库农村移民后期扶持人口核定登记。指导监督全市水利水电工程移民、三峡工程迁入移民后期扶持管理工作。
　　（八）执法科。组织指导水政监察工作。承担重大涉水违法事件的查处。协调跨县级的水事纠纷。负责水利规费征收工作。
　　（九）监督科。督促检查水利重大政策、决策部署和重点工作的贯彻落实情况。组织实施水利工程质量和安全监督。负责水利行业领域安全生产工作。组织指导水库、堤防、水闸、水电站大坝、农村水电站等水利工程的安全监管。
　　（十）水旱灾害防御和水调度管理科。组织指导编制洪水干旱防治规划、防护标准、防御洪水方案及相关应急预案并指导实施。负责监督水利工程防汛抗旱责任制落实，指导水情旱情预警及水利工程应急抢险的技术支撑工作。组织指导水利工程抢险物资储备和工程抢险队伍建设。统计水利设施受灾情况，指导实施水利工程应急度汛项目。组织编制重要江河湖泊和重要水工程的防御洪水、抗御旱灾应急水量调度方案并组织指导实施。负责台风防御期间重要水工程调度工作。指导河湖生态流量水量管理。指导水资源调度工作并监督实施。指导跨县级调水工程前期工作，指导监督跨区域、跨流域水工程的调度管理等工作。
　　（十一）人事科。承担机关和指导直属单位的干部人事、机构编制、劳动工资和离退休人员服务等工作。指导全市水利行业人才队伍建设。组织水利水电专业技术职务的评审并指导本系统专业技术职务的聘任工作。承担水利体制改革有关工作。指导国内外先进技术的引进和推广工作。
　　机关党委。负责机关和直属单位的党群工作。